狠不下心就这么击杀自己的爱徒，于是在猿魔的苦口婆心相劝下，日斩还是眼睁睁的看着大蛇丸逃离了木叶。
而后得到大蛇丸叛逃消息的自来也立马追出了村子，千方百计试图拦下大蛇丸，甚至想通过武力将大蛇丸带回村子。
虽然自来也表面看似下定了决心，但实际上他却无论如何也下不去狠手，而大蛇丸经历过种种黑暗后，一颗心早已变得坚硬如铁，下手也比自来也果断很多。
如果不开启仙人模式的话，大蛇丸与自来也的实力要相差无几，但大蛇丸又比自来也能够下得去狠手，两相对比之下，自来也很快就落入下风，最终还是落败，被大蛇丸击成重伤。
自来也虽然心有万般不甘，但也只能眼睁睁的目睹着大蛇丸离去。
纲手因为心灵受伤，离开村子不愿意再回来，如今就连大蛇丸也叛离了村子，原本让自来也感到温馨的村子如今却变得陌生起来，心灰意冷之下，自来也再也无心留在村子，不等战争结束，就再次踏上了属于他自己的旅途。
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